MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022784	CTT	2	6	357436	357441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_022784	GT	3	6	357576	357581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_022784	CCA	2	6	357664	357669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_022784	CTT	2	6	357682	357687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_022784	TTC	2	6	357703	357708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_022784	CTG	2	6	357730	357735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_022784	TA	3	6	357875	357880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_022784	ACA	2	6	357947	357952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_022784	GC	3	6	357976	357981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_022784	AT	3	6	358018	358023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_022784	C	6	6	358098	358103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2512	NC_022784	TGC	2	6	360796	360801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_022784	CGC	2	6	360837	360842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_022784	GAT	2	6	360849	360854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_022784	GT	3	6	360872	360877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_022784	ACG	2	6	360884	360889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_022784	CTC	2	6	360975	360980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_022784	TGC	2	6	362013	362018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_022784	GTG	2	6	362031	362036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_022784	TTGT	2	8	362057	362064	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_022784	CTT	2	6	362079	362084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_022784	CAG	2	6	362099	362104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_022784	TTG	2	6	362135	362140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_022784	GGA	2	6	362165	362170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_022784	T	7	7	362250	362256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_022784	GCA	2	6	362275	362280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_022784	GCT	2	6	362362	362367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_022784	GAG	2	6	362467	362472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_022784	AG	4	8	362531	362538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_022784	CTTG	2	8	362643	362650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_022784	AAT	2	6	362655	362660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_022784	AAG	2	6	362687	362692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_022784	GGC	2	6	362717	362722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_022784	TACT	2	8	362729	362736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2535	NC_022784	TGC	2	6	362757	362762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_022784	TCGC	2	8	362884	362891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_022784	CTC	2	6	362898	362903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2538	NC_022784	GTC	2	6	362926	362931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_022784	CGA	2	6	362955	362960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_022784	GGT	2	6	363021	363026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_022784	AAC	2	6	363094	363099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_022784	GAT	2	6	363165	363170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_022784	TGA	2	6	363198	363203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_022784	AGG	2	6	363422	363427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_022784	GGA	2	6	363465	363470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_022784	AGA	2	6	363501	363506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_022784	GGA	2	6	363507	363512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_022784	GTT	2	6	363524	363529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_022784	GAG	2	6	363594	363599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_022784	CT	3	6	363621	363626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_022784	GCTG	2	8	363675	363682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_022784	GGA	2	6	363786	363791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_022784	GC	3	6	364016	364021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2554	NC_022784	ATT	2	6	364027	364032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_022784	CTG	2	6	364046	364051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_022784	ACA	2	6	364172	364177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_022784	T	7	7	364209	364215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_022784	TGG	2	6	364259	364264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_022784	GTG	2	6	364390	364395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_022784	TAC	2	6	364411	364416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_022784	TCT	2	6	364419	364424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_022784	TAC	2	6	364474	364479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_022784	CCGA	2	8	364486	364493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2564	NC_022784	A	6	6	364522	364527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_022784	GTA	2	6	364534	364539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_022784	GAA	2	6	364597	364602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_022784	CGG	2	6	364667	364672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_022784	CAG	2	6	364702	364707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_022784	GC	3	6	364878	364883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_022784	ATC	2	6	364972	364977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_022784	AT	3	6	365015	365020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_022784	N	27	27	365039	365065	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_022784	CAG	2	6	365094	365099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_022784	GTG	2	6	365102	365107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_022784	TG	3	6	365106	365111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_022784	AGC	2	6	365118	365123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_022784	TGG	2	6	365139	365144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_022784	CTC	2	6	365239	365244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_022784	TGA	2	6	365282	365287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_022784	TGC	2	6	365333	365338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_022784	CAG	2	6	365349	365354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_022784	ATG	2	6	365374	365379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_022784	TGT	2	6	365397	365402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_022784	CGA	2	6	365411	365416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_022784	ACGC	2	8	366613	366620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2586	NC_022784	TCG	2	6	366645	366650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_022784	GC	3	6	366677	366682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_022784	GGGCT	2	10	366842	366851	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2589	NC_022784	CGC	2	6	366874	366879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_022784	GCC	2	6	366886	366891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_022784	AAG	2	6	367005	367010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_022784	CAA	2	6	367110	367115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_022784	TTC	2	6	367134	367139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_022784	GTTG	2	8	367204	367211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_022784	GTA	2	6	367264	367269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_022784	ACT	2	6	367274	367279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_022784	ACT	2	6	367406	367411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_022784	CTC	2	6	367420	367425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_022784	GAA	2	6	367484	367489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_022784	N	624	624	367587	368210	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_022784	ACG	2	6	368223	368228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_022784	CTG	2	6	368316	368321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_022784	AGC	2	6	368344	368349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_022784	CGC	2	6	368352	368357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_022784	T	6	6	368363	368368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_022784	TGC	2	6	368450	368455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_022784	TGCTG	2	10	368502	368511	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2608	NC_022784	ACT	2	6	368552	368557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_022784	T	6	6	368670	368675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_022784	TG	3	6	368746	368751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_022784	T	6	6	368763	368768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_022784	GTTTT	2	10	368820	368829	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_022784	CGC	2	6	368893	368898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_022784	TCA	2	6	368965	368970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_022784	GCT	2	6	369050	369055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_022784	CGT	3	9	369082	369090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_022784	CGT	2	6	369151	369156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_022784	GT	3	6	369178	369183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_022784	CTA	2	6	369240	369245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_022784	GGT	2	6	369278	369283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_022784	TGG	2	6	369305	369310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_022784	CGG	2	6	369325	369330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_022784	CAC	2	6	369427	369432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_022784	CGG	2	6	369488	369493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_022784	GGTGT	2	10	372632	372641	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_022784	TGC	2	6	372702	372707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_022784	TGT	2	6	374145	374150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_022784	ATT	2	6	378088	378093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_022784	AGCGT	2	10	378122	378131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2630	NC_022784	TAA	2	6	378219	378224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_022784	TG	3	6	378242	378247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_022784	T	6	6	378268	378273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_022784	GCT	2	6	380439	380444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_022784	CTTG	2	8	380466	380473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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